Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prss28Q924N9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prss28Q924N9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms