Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Letmd1Q924L1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms