Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3b5Q923D4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3b5Q923D4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms