Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrif1Q923B3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrif1Q923B3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms