Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clip1Q922J3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clip1Q922J3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clip1Q922J3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms