Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sf3b3Q921M3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b3Q921M3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b3Q921M3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms