Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Sh3bp4Q921I6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp4Q921I6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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