Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Afg3l1Q920A7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l1Q920A7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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