Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smarca5Q91ZW3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms