Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc5a4bQ91ZP4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc5a4bQ91ZP4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc5a4bQ91ZP4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms