Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atl3Q91YH5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms