Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm2Q91YD4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm2Q91YD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms