Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims2Q91XD2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims2Q91XD2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims2Q91XD2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims2Q91XD2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims2Q91XD2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims2Q91XD2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms