Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usb1Q91W78 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usb1Q91W78 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms