Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd3Q91W18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms