Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn3Q91V61 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfxn3Q91V61 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms