Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms