Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cabp4Q8VHC5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cabp4Q8VHC5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms