Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms