Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhdc3Q8VEM9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms