Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc115Q8VE99 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc115Q8VE99 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms