Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf4Q8VE97 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms