Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc58Q8R3Q6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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