Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r212Q8R268 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r212Q8R268 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms