Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CipcQ8R0W1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms