Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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