Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms