Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nsl1Q8K305 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nsl1Q8K305 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms