Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms