Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Depp1Q8K2F3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Depp1Q8K2F3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms