Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms