Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms