Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms