Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Tshz3Q8CGV9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Tshz3Q8CGV9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Tshz3Q8CGV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tshz3Q8CGV9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tshz3Q8CGV9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms