Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upp2Q8CGR7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms