Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Setd1bQ8CFT2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Setd1bQ8CFT2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Setd1bQ8CFT2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Setd1bQ8CFT2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Setd1bQ8CFT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms