Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brf1Q8CFK2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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