Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms