Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pramef8Q8CE24 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pramef8Q8CE24 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pramef8Q8CE24 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pramef8Q8CE24 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Pramef8Q8CE24 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef8Q8CE24 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pramef8Q8CE24 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pramef8Q8CE24 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pramef8Q8CE24 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pramef8Q8CE24 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef8Q8CE24 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms