Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc17Q8CE13 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms