Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph6aQ8CDR2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms