Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc87Q8CDL9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc87Q8CDL9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms