Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrip1Q8CBD1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrip1Q8CBD1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nrip1Q8CBD1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrip1Q8CBD1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms