Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slfn5Q8CBA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slfn5Q8CBA2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms