Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dclre1bQ8C7W7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dclre1bQ8C7W7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms