Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col6a6Q8C6K9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a6Q8C6K9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Col6a6Q8C6K9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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