Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp47Q8BY87 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp47Q8BY87 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms