Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Iffo1Q8BXL9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Iffo1Q8BXL9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Iffo1Q8BXL9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Iffo1Q8BXL9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Iffo1Q8BXL9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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