Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actrt3Q8BXF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Actrt3Q8BXF8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms