Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp5Q8BX09 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms